Hallo Ottmar,
Klingt für mich nach einer Aufgabe für ein hardware-raid1. Die vorhandene Platte verdoppeln und 1:1 redundant nutzen. Vorher ein Image der aktuellen Platte ziehen und nach Einrichtung des raid1 im (oder kurz nach dem) mainboard bios das Image wieder einspielen, welches dann wie alle anderen daten auch automatisch redundant gespeichert werden.
Zum backupen von nur einzelnen Ordnern unter MS bietet sich das hauseigene Sync Framework an. Ähnliches gibts sicher auch unterm Pinguin.
Vg
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