Hej!
Ich hab meines wissens den stand der vor der spielerei vorherschte. Und mitlweile alles raugekippt und alle .conf's und vHost conf's zig mal gelesen und mit zig anderen Anleitung versucht die domains von Grund auf wieder neu zu erstellen. Ohne erfolg. bei allein domains lande ich immer auf /var/www
Sicherheitsfrage: Du lässt den Apache seine Config immer wieder neu laden nach jeder Änderung, oder?
[Tue May 28 22:29:04 2013] [warn] NameVirtualHost *:80 has no VirtualHosts
Zu gut Deutsch: 'Ich weiß, dass ich vhosts ausliefern soll, habe aber keine Direktiven mit virtuellen Namen und zugehörigen Verzeichnissen gefunden'. Hier dürfte dein Problem zu finden sein.
Beste Grüße Fabian