Hallo Andre,
die grundsätzliche Antwort, nämlich das Auftrennen der Mailbox für procmail ist ja schon gekommen. Jedoch würde ich dafür einfach formail nehmen, der kann nämlich Mails trennen (hatte früher mal ein Script das mir diverse MLs auf meinem Uni-Account in 50er Blöcke gepackt hat und dann zu Hause hat ein anderes Script alles wieder klein gemacht).
Und wenn Du dir dann die Rules für procmail erstellt hast, kannst Du dann gleich alle einlaufende Mail einsortieren... Procmail kann übrigens auch in bessere Formate als mbox filtern (mh, maildir -- maildir wird leider kaum von MUAs unterstützt).
Tschüß, Carsten